صندوق پژوهش و فناوری استان یزد مطابق با آیین نامه اجرای هیئت وزیران، در اسفندماه سال 1383 به ثبت رسید. این صندوق در حال حاضر با سرمایه ثبتی به مبلغ 1.100.000.000.000ریال و با ترکیب سهامداری 31 درصد بخش دولتی و 69 درصد بخش خصوصی مشغول به فعالیت می¬باشد. سهامداران عمده آن عبارتند از: دولت جمهوری اسلامی ایران، پارک علم و فناوری یزد، شرکت تعاونی خدماتی پیشگامان کویر، دانشگاه یزد و دیگر سهامداران این صندوق با اعطای تسهیلات در قالب وام با نرخ ترجیحی، صدور ضمانت¬نامه بانکی، سرمایه گذاری خطرپذیر، مشاوره و ارزیابی طرح¬های اقتصادی به اکوسیستم فناوری و نوآوری خدمت می کند. شایان ذکر است صندوق پژوهش و فناوری استان یزد قدیمی ترین صندوق پژوهش و فناوری کشور می باشد که تاکنون بسیاری از شرکت های فناور و دانش بنیان از خدمات آن بهره مند شده اند.